Les microplaques : un outil clé pour la recherche et le dénombrement des E. coli et des entérocoques dans les eaux
La multiplication des phénomènes climatiques extrêmes, tels que les vagues de chaleur et les fortes pluies estivales augmente le risque de contamination microbienne dans l’eau. La surveillance microbiologique des eaux est un enjeu majeur de santé publique.
Parmi les indicateurs les plus utilisés pour évaluer la contamination figurent Escherichia coli et les entérocoques intestinaux. Aujourd’hui, l’utilisation des microplaques s’impose comme une méthode fiable, standardisée et adaptée aux besoins des laboratoires pour l’analyse des eaux de baignade en mer et en eau douce, les eaux de surface et les eaux résiduaires.
Pourquoi rechercher les E. coli et entérocoques dans l’eau ?
E.coli et les entérocoques sont des bactéries indicatrices de pollution. Leur présence dans une eau destinée à la consommation humaine, à la baignade ou à un usage récréatif traduit un risque sanitaire potentiel, notamment la présence de micro‑organismes pathogènes.
- E. coli est l’indicateur privilégié de contamination fécale récente.
- Les entérocoques intestinaux sont plus résistants dans l’environnement et constituent un bon marqueur de pollution persistante, en particulier en eaux de baignade.
La réglementation européenne et internationale impose donc des normes pour garantir la qualité microbiologique des eaux tels que
- ISO 9308-1 : Dénombrement de E. coli et des coliformes par filtration sur membrane pour les eaux à faible teneur en bactéries
- ISO 9308-3 : Recherche et dénombrement des Escherichia coli et des bactéries coliformes par la méthode du nombre le plus probable dans les eaux de surface et résiduaires
- ISO 7899-1 : Recherche et dénombrement des entérocoques intestinaux par filtration sur membrane, avec équivalent en méthode du nombre le plus probable pour les eaux de surface et résiduaires
Le principe des microplaques en analyse de l’eau
Les microplaques sont des supports multi‑puits (généralement 96) permettant de réaliser des analyses microbiologiques de manière miniaturisée et standardisée. Appliquées à la microbiologie de l’eau, elles reposent sur le principe du Nombre le Plus Probable (NPP) combiné à des réactions enzymatiques spécifiques.
Chaque puits contient un milieu de culture déshydraté qui, après ajout de l’échantillon d’eau et incubation, permet la croissance des bactéries ciblées et leur identification grâce à un substrat chromogénique ou fluorescent.
Cette approche présente plusieurs avantages :
- gain de temps et de place en laboratoire ;
- lecture facilitée et calcul automatisable ;
- réduction des manipulations et des risques de contamination croisée.
Les microplaques MUG/EC et MUD/SF
Biokar Diagnostics propose des solutions reconnues pour l’analyse microbiologique des eaux, notamment les microplaques MUG/EC et MUD/SF, spécifiquement conçues pour la méthode NPP. Elles sont complétées par Biokar Microplates, une plateforme digitale sécurisée, simple d’utilisation, pour le calcul rapide, simplifié.
Microplaque MUG/EC – Détection de E. coli
La microplaque MUG/EC est dédiée à la recherche et au dénombrement de E. coli suivant la méthode ISO 9308-3. Cette méthode a été développée pour une utilisation dans l’analyse de plusieurs types d’eaux, notamment les eaux de baignade en mer et en eau douce, les eaux de surface et les eaux résiduaires.
Elle s’appuie sur la détection de l’activité β glucuronidase, enzyme caractéristique de la majorité des souches d’E. coli.
Les puits produisent une fluorescence bleue sous UV en cas de réaction positive après une incubation de 48 heures à 44 ± 1°C.
Cette microplaque offre une solution fiable pour les analyses de routine et les contrôles réglementaires des eaux.
Microplaque MUD/SF – Détection des entérocoques intestinaux
La microplaque MUD/SF est conçue pour la mise en évidence des entérocoques intestinaux suivant la méthode NF EN ISO 7899-1.
Cette méthode a été également développée pour une utilisation dans l’analyse de plusieurs types d’eaux, notamment les eaux de baignade en mer et en eau douce, les eaux de surface et les eaux résiduaires.
Les puits produisent une fluorescence bleue sous UV en cas de réaction positive après une incubation de minimum 36 heures à 44 ± 1°C.
La technique en microplaques avec utilisation de MUD a été reconnue comme étant plus spécifique, plus précise, plus juste et plus rapide que les méthodes utilisées antérieurement. Elle représente une évolution importante par rapport aux techniques habituelles pour les entérocoques qui, parmi les microorganismes indicateurs de contamination fécale, présentent un intérêt tout particulier.
Conclusion
L’utilisation des microplaques pour la détection d’E. coli et des entérocoques représente aujourd’hui une solution efficace et conforme aux normes en vigueur. Combinant fiabilité, simplicité d’utilisation et standardisation des résultats, elles répondent parfaitement aux exigences des laboratoires d’analyses de l’eau.